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(1)、B是不能對A提出侵害重製權的告訴，因為出資人Ａ的利用權是依著作權法第12條的規定，而不是基於A與B之間的約定，Ａ不付款僅是屬於民事債務不履行之損害賠償責任範疇（最高法院100年台上字第1895號民事判決參照），所以Ａ並沒有侵害Ｂ的重製權。
(2)、B仍有向A提起請求給付報酬的權利。另B亦可看雙方是否解除該聘任契約之事由，解除契約後，A廠商即無利用的權利，再採取後續法律行動

有可能的，營業秘密法第13-1條有相關規定…千萬不要做這種事…

當然不同啊，商標主要的考量是使用的急迫性，但專利則有很多的方案可以考慮申請優先審查。